Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3bQ9Z321 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top3bQ9Z321 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3bQ9Z321 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3bQ9Z321 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms