Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hdac5Q9Z2V6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hdac5Q9Z2V6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hdac5Q9Z2V6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hdac5Q9Z2V6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms