Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms