Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd2Q9Z2E1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mbd2Q9Z2E1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd2Q9Z2E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd2Q9Z2E1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266 ms