Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B3

Rgr, RPE-retinal G protein-coupled receptor, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgrQ9Z2B3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgrQ9Z2B3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgrQ9Z2B3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RgrQ9Z2B3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RgrQ9Z2B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgrQ9Z2B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RgrQ9Z2B3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RgrQ9Z2B3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms