Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rlbp1Q9Z275 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rlbp1Q9Z275 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rlbp1Q9Z275 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms