Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tulp1Q9Z273 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tulp1Q9Z273 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tulp1Q9Z273 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tulp1Q9Z273 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms