Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne2Q9Z238 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccne2Q9Z238 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne2Q9Z238 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne2Q9Z238 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms