Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ror1Q9Z139 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ror1Q9Z139 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ror1Q9Z139 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ror1Q9Z139 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms