Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NgfrQ9Z0W1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NgfrQ9Z0W1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms