Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf15Q9Z0J7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gdf15Q9Z0J7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf15Q9Z0J7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf15Q9Z0J7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms