Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp1Q9WTX5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp1Q9WTX5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp1Q9WTX5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms