Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv2Q9WTR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv2Q9WTR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv2Q9WTR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpv2Q9WTR1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv2Q9WTR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms