Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc2Q9R244 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc2Q9R244 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc2Q9R244 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc2Q9R244 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms