Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma1Q9R1P4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma1Q9R1P4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma1Q9R1P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma1Q9R1P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms