Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK7

Dok3, Docking protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok3Q9QZK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok3Q9QZK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok3Q9QZK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dok3Q9QZK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms