Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChmlQ9QZD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ChmlQ9QZD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChmlQ9QZD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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