Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps29Q9QZ88 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps29Q9QZ88 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps29Q9QZ88 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms