Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn8Q9QZ49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn8Q9QZ49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn8Q9QZ49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn8Q9QZ49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms