Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ39

St6galnac1, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac1Q9QZ39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
St6galnac1Q9QZ39 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
St6galnac1Q9QZ39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
St6galnac1Q9QZ39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
St6galnac1Q9QZ39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms