Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vnn3Q9QZ25 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vnn3Q9QZ25 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vnn3Q9QZ25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vnn3Q9QZ25 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms