Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapbQ9QY76 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VapbQ9QY76 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VapbQ9QY76 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms