Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN0

Shroom3, Protein Shroom3, mousemouse

Predictions only

Length 1,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom3Q9QXN0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom3Q9QXN0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shroom3Q9QXN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shroom3Q9QXN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shroom3Q9QXN0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom3Q9QXN0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom3Q9QXN0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms