Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apbb1Q9QXJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apbb1Q9QXJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apbb1Q9QXJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms