Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trp53inp1Q9QXE4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trp53inp1Q9QXE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms