Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chaf1aQ9QWF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chaf1aQ9QWF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chaf1aQ9QWF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chaf1aQ9QWF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms