Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tcea2Q9QVN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcea2Q9QVN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms