Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid2Q9QUS6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid2Q9QUS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mid2Q9QUS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms