Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psma6Q9QUM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma6Q9QUM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma6Q9QUM9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms