Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln8Q9QUK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln8Q9QUK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln8Q9QUK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms