Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Txnrd1Q9JMH6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Txnrd1Q9JMH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Txnrd1Q9JMH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Txnrd1Q9JMH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Txnrd1Q9JMH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Txnrd1Q9JMH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms