Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd2apQ9JLQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd2apQ9JLQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cd2apQ9JLQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms