Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp2Q9JLK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp2Q9JLK4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp2Q9JLK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cabp2Q9JLK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cabp2Q9JLK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms