Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Aldh9a1Q9JLJ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms