Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LitafQ9JLJ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LitafQ9JLJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LitafQ9JLJ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LitafQ9JLJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms