Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr10Q9JL21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr10Q9JL21 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr10Q9JL21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr10Q9JL21 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr10Q9JL21 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms