Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a3Q9JKZ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a3Q9JKZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms