Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ybx3Q9JKB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ybx3Q9JKB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ybx3Q9JKB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ybx3Q9JKB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Ybx3Q9JKB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms