Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnq4Q9JK97 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnq4Q9JK97 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnq4Q9JK97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnq4Q9JK97 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnq4Q9JK97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms