Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd3Q9JJY3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd3Q9JJY3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms