Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJL8

Sars2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sars2Q9JJL8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sars2Q9JJL8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sars2Q9JJL8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sars2Q9JJL8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sars2Q9JJL8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms