Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riox1Q9JJF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riox1Q9JJF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riox1Q9JJF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms