Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ercc6l2Q9JIM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ercc6l2Q9JIM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ercc6l2Q9JIM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms