Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclre1aQ9JIC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclre1aQ9JIC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dclre1aQ9JIC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dclre1aQ9JIC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms