Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl1Q9JI74 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl1Q9JI74 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl1Q9JI74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms