Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EefsecQ9JHW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EefsecQ9JHW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EefsecQ9JHW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EefsecQ9JHW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms