Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp29Q9ES63 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp29Q9ES63 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp29Q9ES63 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp29Q9ES63 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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