Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube3bQ9ES34 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube3bQ9ES34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube3bQ9ES34 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube3bQ9ES34 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ube3bQ9ES34 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ube3bQ9ES34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms