Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk3Q9ERH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk3Q9ERH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms