Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tfcp2Q9ERA0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tfcp2Q9ERA0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfcp2Q9ERA0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms